Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Becn2P0DM65 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms