Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UbbP0CG49 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UbbP0CG49 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms