Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms