Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms