Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtrP07309 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtrP07309 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtrP07309 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TtrP07309 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtrP07309 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtrP07309 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtrP07309 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtrP07309 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtrP07309 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtrP07309 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtrP07309 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtrP07309 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TtrP07309 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtrP07309 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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