Protein–RNA interactions for Protein: P06797

Ctsl, Cathepsin L1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtslP06797 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtslP06797 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtslP06797 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtslP06797 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtslP06797 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtslP06797 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtslP06797 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtslP06797 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtslP06797 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtslP06797 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms