Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa4P06728 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms