Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CrygdP04342 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CrygdP04342 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms