Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-Eb1P04230 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms