Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04214 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04214 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04214 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04214 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04214 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04214 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04214 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04214 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04214 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms