Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tk1P04184 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tk1P04184 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tk1P04184 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms