Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01843 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01843 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01843 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01843 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01843 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01843 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01843 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01843 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01843 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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