Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01673 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01673 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01673 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01673 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01673 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01673 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01673 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01673 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01673 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01673 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01673 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01673 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms