Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01648 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01648 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01648 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01648 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01648 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01648 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01648 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01648 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01648 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01648 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01648 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01648 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01648 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01648 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01648 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01648 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01648 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01648 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01648 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01648 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms