Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccl20O89093 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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