Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BlmO88700 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BlmO88700 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BlmO88700 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BlmO88700 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BlmO88700 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BlmO88700 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BlmO88700 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BlmO88700 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BlmO88700 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BlmO88700 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BlmO88700 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BlmO88700 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BlmO88700 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BlmO88700 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms