Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClppO88696 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClppO88696 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClppO88696 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClppO88696 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClppO88696 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClppO88696 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClppO88696 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClppO88696 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClppO88696 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClppO88696 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ClppO88696 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClppO88696 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClppO88696 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClppO88696 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ClppO88696 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClppO88696 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClppO88696 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClppO88696 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClppO88696 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClppO88696 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ClppO88696 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ClppO88696 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ClppO88696 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
ClppO88696 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClppO88696 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms