Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CntfrO88507 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms