Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AvilO88398 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AvilO88398 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AvilO88398 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AvilO88398 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AvilO88398 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AvilO88398 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AvilO88398 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AvilO88398 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
AvilO88398 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AvilO88398 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AvilO88398 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AvilO88398 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AvilO88398 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AvilO88398 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AvilO88398 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AvilO88398 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms