Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtssO70370 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtssO70370 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtssO70370 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtssO70370 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtssO70370 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms