Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna4O70174 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms