Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Top3aO70157 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top3aO70157 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms