Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldb2O55203 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms