Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cbx4O55187 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms