Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms