Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc3O55013 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms