Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn5O54942 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms