Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2f6O54917 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2f6O54917 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2f6O54917 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2f6O54917 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms