Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb3O54890 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms