Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl25O35903 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms