Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npc1O35604 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Npc1O35604 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npc1O35604 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms