Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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