Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk2O35491 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms