Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Slc27a2O35488 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Slc27a2O35488 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Slc27a2O35488 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Slc27a2O35488 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Slc27a2O35488 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Slc27a2O35488 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Slc27a2O35488 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Slc27a2O35488 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Slc27a2O35488 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Slc27a2O35488 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc27a2O35488 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc27a2O35488 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc27a2O35488 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Slc27a2O35488 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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