Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms