Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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H2-ObO35424 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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H2-ObO35424 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H2-ObO35424 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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