Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna3O35344 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms