Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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