Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnk3O35111 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnk3O35111 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnk3O35111 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Kcnk3O35111 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnk3O35111 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Kcnk3O35111 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Kcnk3O35111 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Kcnk3O35111 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Kcnk3O35111 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Kcnk3O35111 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Kcnk3O35111 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnk3O35111 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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