Protein–RNA interactions for Protein: O08796

Eef2k, Eukaryotic elongation factor 2 kinase, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eef2kO08796 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eef2kO08796 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eef2kO08796 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms