Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms