Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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MsmbO08540 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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