Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp35M0QWN7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms