Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3239L7N2D9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3239L7N2D9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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