Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r88L7N1W8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms