Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2056J3QQ02 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms