Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer2J3QPU5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms