Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms