Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn34c2J3QNM1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c2J3QNM1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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