Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm21972J3QN38 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm21972J3QN38 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm21972J3QN38 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm21972J3QN38 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm21972J3QN38 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm21972J3QN38 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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